
В 1981 году окончил факультет радиотехники и кибернетики Московского физико-технического института.
С 1979 по 1988 годы работал в Институте автоматики и процессов управления ДВО РАН.
С 1988 работает в Институте проблем морских технологий ДВО РАН. В 1994 году защитил докторскую диссертацию.
В 2006 году был избран членом-корреспондентом РАН. Состоит в Дальневосточном отделении РАН. Директор Института проблем морских технологий ДВО РАН.
В ноябре 2020 года Щербатюк был арестован. СУ СКР по Приморью сообщило, что в отношении директора ИПТМ ДВО РАН возбуждено уголовное дело по подозрению в злоупотреблении должностными полномочиями (ч. 1 ст. 285 УК РФ):
«В период времени с октября 2016 года по июль 2018 года подозреваемый заключил от имени института контракт с иностранной компанией на изготовление автономного необитаемого подводного аппарата на сумму свыше 17,5 млн руб. в рублевом эквиваленте.
При этом он знал, что материальное обеспечение и штат сотрудников, необходимых для производства аппарата отсутствует, и фактически работы будут выполняться за счет особо ценного недвижимого имущества и имущества, находящегося на оперативном управлении института, а также с помощью работников института. В результате указанных действий подозреваемого доходы в сумме свыше 7,5 миллионов рублей не поступили в распоряжение института».